Windows XP Service Pack 2、Service Pack 3およびWindows Vistaに搭載されている「Windows ファイアウォール」とウイルスバスター2009の「パーソナルファイアウォール」機能を同時に利用しても問題はありません。

ただし、同じ通信を互いに監視することにより、ネットワークの処理速度などが低下する可能性が考えられます。

ウイルスバスター2009のパーソナルファイアウォールをご利用になる場合は、Windowsファイアウォールを無効に設定することをお勧めします。

Windowsファイアウォールを無効に設定する方法につきましては、コンピュータ製造元、またはMicrosoft社にお問い合わせください。

参考：
マイクロソフト サポート技術情報 884156(他社製ファイアウォールソフトを使う場合)